《NieR:Automata》讲述了机器人 2B、9S 和 A2 的故事，以及他们为夺回遭强大机械生命体占领、由机器驱动的反乌托邦而进行的战斗。

人类已经被来自另一个世界的机械生命体赶出了地球。为了夺回地球，人类抵抗军孤注一掷，派遣了一支人形机器人士兵军队，以摧毁入侵者。现在，机械生命体和人形机器人之间的战争开始了……而这场战争可能很快就将揭开一个早已被遗忘的世界真相。